安皇帝名德宗，字德宗，是孝武帝的长子。太元十二年八月辛巳，被立为皇太子。二十一年九月庚申，孝武帝去世。辛酉，太子即皇帝位，大赦天下。癸亥，任命司徒、会稽王道子为太傅，代理朝政。冬十月甲申，将孝武皇帝葬在隆平陵。天降大雪。
隆安元年春正月己亥初一，皇帝加冕，改年号，给文武官员增加一等官级。太傅、会稽王道子稽首还政。任命尚书左仆射王殉为尚书令，领军将军王国宝为尚书左仆射。二月，吕光的部将秃发乌孤自称为大都督、大单于，国号为南凉。在金昌攻打吕光的部将窦苟，大败他的军队。三月甲寅，尊奉皇太后李氏为太皇太后。戊午，立王氏为皇后。吕光的儿子吕纂被乞伏干归打败。吕光的部下建康太守段业自号为凉州牧。慕容实在蓟打败魏军。夏四月甲戌，兖州刺史王恭、豫州刺史庾楷起兵，名义是讨伐尚书左仆射王国宝、建威将军王绪。甲申，杀掉国宝和王绪来取悦于王恭，王恭才罢兵。戊子，大赦天下。五月，前司徒长史王厂在吴郡谋反，王恭征讨平定了他。慕容实的部将慕容详在中山即位为伪皇帝，慕容宝逃奔黄龙。秋八月，吕光受到他的仆射杨轨、散骑常侍郭摩攻打，吕光的儿子吕纂打跑了他们。九月，慕容实的部将慕容麟在中山斩杀了慕容详，随后即位为伪皇帝。冬季十月，慕容麟被魏军打败。
二年春三月，龙舟两次失火。夏五月，兰汗杀慕容实后自称为大将军、昌黎王。秋七月，慕容宝的儿子慕容盛斩兰汗，僭称为长乐王，摄天子位。兖州刺史王恭、豫州刺史庾楷、荆州刺史殷仲堪、广州刺史桓玄、南蛮校尉杨佺期等人起兵反叛。八月，江州刺史王愉逃奔到临。丙子，宁朔将军邓启方在管城和慕容德的部将慕容法交战，王师被打败。丙戌，慕容盛在黄龙僭位称皇帝。桓玄在白石大败王师。九月辛卯，加太傅、会稽王道子黄铁。派遣征虏将军会稽王的世子元显、前将军王殉、右将军谢琰讨伐桓玄等人。己亥，在牛渚打败庾楷。丙午，会稽王道子屯兵中堂，元显守石头。己酉，前将军王殉防守北郊，右将军谢琰守备宣阳门。辅国将军刘牢之驻在新亭，派儿子敬宣打败王恭，王恭逃奔曲阿长塘湖，湖尉拘捕他送到京城，斩了他。于是派遣太常殷茂晓谕仲堪和桓玄，桓玄等到寻阳。冬十月，新野报告说有义兽出现。丙子，大赦天下。壬午，仲堪等人在寻阳结盟，推举桓玄为盟主。十一月，任命琅邪王德文为卫将军、开府仪同三司，任命领军将军王雅为尚书左仆射。十二月己丑，魏王拓跋珪登皇帝位，年号为天兴。京兆人韦华率襄阳的流民反叛，向姚兴投降。己酉，前新安太守杜炯在京1：3反叛，会稽王世子元显讨伐斩了他。秃发乌孤自称为武威王。
三年春正月辛酉，封宗室中的司马蕴为淮陵王。二月甲辰，河间王国镇去世。林邑的范胡达攻陷日南、九真，接着侵扰交吐，太守杜瑗讨伐打败了他。段业自称凉王。仇池公杨盛派遣使者来表示愿为藩属，献上土产物品．。三月己卯，追尊生母陈夫人为德皇太后。夏四月乙未，加授尚书令王殉为卫将军，任命会稽王世子元显为扬州刺史。六月戊子，任命琅邪王德文为司徒。基窖德攻陷青州，害死龙骧将军辟间浑，于是在广固僭号登皇帝位。秋八月，秃发乌孤死，他的弟弟利鹿孤继承伪位。冬十月，姚兴攻陷洛阳，俘虏河南太守辛恭靖。十一月甲寅，妖贼孙恩攻陷会稽，内史王凝之死难，吴国内史桓谦、临海太守新蔡王司马崇、义兴太守魏隐都弃官逃走，呈璺太守谢邈、丞台太守司马逸都被害。派遣卫将军谢琰、辅国将军刘牢之迎击，打跑了他。十二月，担室袭击，型业刺史壁垒哩、南蛮校尉杨佺期一起被害。吕光立他的太子吕绍为天王，自称太上皇。当天，吕光死，吕纂杀吕绍然后自立。造一年，荆州发大水，平地水深三丈。
四年春正月乙亥，大赦天下。二月己丑，有彗星出现在奎宿和娄宿之间，进到紫微星座。三月，彗星出现在太微。夏四月，地震。孙恩侵扰这旦。五月丙寅，散骑常侍、卫将军、束亭侯王曲卒。己卯，盒稽内史邀堕被茎墨打败，战死。孙恩转而侵扰临海。六月庚辰初一。有日食。旱。辅国司马刘裕在南山打败孙恩。孙恩部将卢循攻占广陵，死者三千多人。任命琅邪王的师傅坦迢为尚书左仆射。秋七月壬子，太皇太后奎压去世。丁卯，大赦天下。当月，姚兴讨伐乞丛越匿，使他投降。八月丁亥，尚书右仆射王雅去世。壬寅，将文太后安葬在脩平陵。九月癸丑，地震。冬十一月，宁朔将军高雅之在余姚和茎墨交战，王师被打败。任命扬州刺史元显为后将军、开府仪同三司、都督扬豫徐兖青幽冀并抱丝司壅銮益奎卢十六州诸军事，任命前将军刘牢之为镇北将军，封豆题的儿子童建为塞捏王。十二月戊寅，有彗星出现在天市星一带。遣一年，回右各郡把凉武昭王李玄盛奉为台痉二州牧、凉公，年号庚子。
五年春丙子，孙恩再次侵犯浃。吕超杀吕纂，让他的兄长吕隆即伪天子位。三月甲寅，很多星星向西坠落，经过太微星垣。夏五月，孙恩侵扰沪渎，吴国内史袁山松战死。沮渠蒙逊杀死段业，自称为大都督、北凉州牧。六月甲戌，孙恩到丹徒。乙亥，内外全部戒严，百官住进台省官署。冠军将军高素、右卫将军张崇之守卫石头，辅国将军刘袭用木栅阻断淮口，丹杨尹司马恢之驻守南岸，冠军将军桓谦、辅国将军司马允之、游击将军毛邃守备白石，左卫将军王嘏、领军将军孑安国驻屯中皇堂。征召豫州刺史、谯王尚之来保卫京师。宁朔将军高雅之在广陵的郁洲攻打孙恩，被俘虏。秋七月，段玑杀慕容盛，慕容盛的叔父慕容熙杀光了段氏家族的人，随后自称皇帝。九月，吕隆投降姚兴。冬十月，姚兴统率军队侵犯魏，大败而回。逭一年，有饥荒，禁止造酒。
五兴元年春正月庚午初一，大赦，改年号。任命后将军元显为骠骑大将军、征讨大都督，任命镇北将军刘牢之为元显前锋，前将军、谯王尚之为后部，去讨伐桓玄。二月丙午，皇帝身着戎装在西池给元显饯行。丁巳，派遣兼侍中、齐王柔之用鶸虞幡通告荆、江二州。丁卯，桓玄在姑孰打败王师，谯王尚之、齐王柔之一起死难。任命右将军吴隐之为都督交广二州诸军事、广州刺史。三月己巳，刘牢之背叛而向桓玄投降。辛未，王师在新亭大败，骠骑大将军、会稽王世子元显，束海王彦璋，冠军将军毛泰，游击将军毛邃一起遇害。壬申，桓玄自任侍中、丞相、录尚书事，任命桓谦为尚书仆射，将太傅、会稽王道子迁居到安城。桓玄不久又自称为太尉、扬州牧，总理政事，以琅邪王德文为太宰。堕擅太守圭量攻打逐墨，杀了他。当月，秃毖鹿孤死，弟弟僻檀继承伪位。秋七月乙亥，新蔡王司马崇被他的奴仆害死。八月庚子，尚书的私宅发生火灾。冬十月，冀州刺史刘轨背叛逃奔基查擅。十二月庚申，会稽王道王被但玄杀害。特赦广陵、彭城犯大逆罪以下的罪人。
二年春二月辛丑，建威将军刘裕在束阳打败徐道覆。乙卯，桓玄自称为大将军。丁巳，冀州刺史孙无终被桓玄杀害。夏四月癸巳初一，有日食。秋八月，桓玄又自称为相国、楚王。九月。南阳太守庾仄起兵，被桓玄打败。冬十一月壬午，桓玄将皇帝迁到永安宫。癸未，把太庙裹的祖先牌位移到琅邪国。十二月壬辰，桓玄篡夺皇帝位，让昼壹作平固王。辛亥，皇帝被囚禁在寻阳。
三年春二月，安帝在寻阳。庚寅夜，江水涌入互题，冲走财物淹死人。乙卯，建武将军刘裕统率沛国人刘毅、束海人何无忌等起兵。丙辰，在塞旦斩担宝委任的鳖蛆刺史但恺，在卢堕斩担宝委任的壹业刺史但丛。丁巳，义军渡过垦逗。三月戊午，刘裕在江乘斩桓玄的部将吴甫之，在醚斩皇直苏。己未，担玄的部众溃乱逃跑。庚申，刘裕设留台，置百官。壬戌，桓玄的司徒王箠推举塑噬暂为镇军将军、涂业刺史、都督荡涂蛮邀壹冀幽差八州诸军事、假节。型整任命王赣兼任握蛆刺史、绿尚书事。辛酉，塑隘杀尚书左仆射王愉、王愉的儿子荆州刺史王绥、司州刺史退谨。辛未，垣室挟持窒童西走。丙戌，秘密下韶说因为被桓玄幽禁逼迫，国事无法处理。命令武陵王司马遵依照旧有的典章规定，秉承皇帝旨意总领百官处理政事，加授侍中，其余官职如旧。并且大赦除了谋反大逆罪以下的犯人，仅有鱼室同族人不能宽恕。夏四月己丑，大将军、武陵王司马遵行使皇帝权力，总理朝政。庚寅，宝童到达辽庐。庚戌，辅国将军何无忌、振武将军刘道担在鱼旦和垣宝部将厘整、何适之交战，大败他们的军队。桓玄挟持安帝束走。五月癸酉，冠军将军刘毅与桓玄在峥嵘洲交战，又打败敌军。己卯，帝再一次到江陵。辛巳，荆州别驾王康产、卖登太守王剩之侍奉帝住在直璺。壬午，督护冯迁在貊盘洲斩了桓玄。皇帝从江陵返回京城。甲申，下诏说：“奸贼凶人篡位谋逆，自古就有。朕不能遏制防止他们，以至于流亡在外。依靠镇军将军刘裕发挥英才大略，有绝代的忠诚和勇武，以及冠军将军刘毅等忠臣名将，共同制定良策。义兵的声威传开后，士人庶民来效忠，江山才得以安定，四海黎民一起欢庆。特此大赦，凡是因威逼而事奉屈服于叛逆者的，一概不问罪。”戊寅，将祖先牌位归位太庙。闰月己丑，盘旧部扬武将军担递攻陷堰，刘堑、包躯；退守到曼堡，窒童再次被劫持到贼营裹。六月，垫刺史王壁讨伐伪銮业刺史堕画，斩了他。秋季七月戊申，永安皇后何氏去世。八月癸酉，将叠童童皇后合葬在丞垩堕。九月，前给事中旦壁、秘书丞王艳谋反，被处死。冬十月，卢钟侵扰卢丛，刺史呈庐之被卢钟打败，俘虏了堕兴相医腆主而离去。摹查擅死，兄长的儿子慕容超继承伪位。
盏塑元年春正月，玄童在红尘。一太守叠塞之兴义兵，袭击攻破塞屋。己丑，型堑进驻墨垩。担握带着塞童驻屯在丝达。辛卯，塞主在韭选打败但钟的部将温揩，进兵驻在挺直，被担铲打败。振武将军型道捏攻打担遂，打跑了他。塞童回来，与堕巫王回到道捏的船上。戊戌，下诏说：“朕因为缺乏仁德，过早继承洪大的基业。不能够使远近四方安定和平，制服好人叛逆。逆臣蛙乘机肆行作乱，竟然欺瞒上天和百姓，篡夺皇帝的位置。朕遭流亡，沦落到荒远的地方，宣皇的基业，衰颓败落。幸有镇军将军刘裕忠诚勇武英明果断，忠诚冠绝古今。运筹谋划定计时，坚贞贤良的人协同他一起费心；含愤挥泪率众誓师时，忠义的战士被他的忠心感动。所以挥戈一击，奸猾奔走逃散，将帅威风势不可挡，大恶之人授首伏罪。可是余孽桓振仍然猖狂，继续逞凶于型竖。庆幸的是上天保佑社稷，义军接连报捷，凶暴的恶党沮丧溃败，朕得以返回。逭实在是祖宗神灵的庇护，勤王者的功勋。朕岂能独自一人享受那份福气，想和亿兆百姓，共庆遣国运的新生。特此大赦，改年号，衹有桓玄桓振的族人和同党不在赦免之列。赐百官官秩二级，赐鳏寡孤独每人五斛谷，大会饮宴五天。”二月丁巳，留台备好车马，去江陵迎回皇帝。弘农太守戴宁之、建威主簿徐惠子等人围谋反叛，被处死。平西参军谯纵害死平西将军、益州刺史毛璩，领蜀地反叛。三月，桓振再次袭击江陵，荆州刺史司马休之逃奔到襄阳。建威将军刘怀肃讨伐桓振，斩了他。帝自江陵到达京城。乙未，百官到宫门请罪。下韶说：“这不是各位的过错，还是回去各司其职吧。”戊戌，为章皇后举哀三日，在西堂临吊。刘裕和何无忌等人上表请求准许让位，没有准许。庚子，任命琅邪王德文为大司马，武陵王司马遵为太保，加授镇军将军刘裕为侍中、车骑将军、都督中外诸军事。甲辰，下诏说：“自从不久前国难发生之后，人口物产大量减少，可是日常的供给，还没有改变旧有的规定，岂是古人告诫的对百姓像对待伤口一样爱护，像禹汤那样将过失归于自己的行为!可以斟酌减免和俭省。”夏四月，刘裕回去镇守京口。戊辰，在东堂饯行。五月癸未，禁止制造绢扇和赌博游戏。游击将军、章武王司马秀，益州刺史司马轨之谋反，被处死。桓玄的故将桓亮、苻宏、刁预侵犯湘州，守将打跑了他们。秋八月甲子，封临王的儿子脩之为会稽王。冬十一月，乞伏干归攻打仇池，仇池公杨盛大破他们。这一年，凉武昭王玄盛派遣使者上表愿称藩国。
二年春正月，益州刺史司马荣期在白帝攻打谯纵的部将谯子明，打败了他。夏五月，封高密王的儿子法莲为高阳王。秋七月，梁州刺史杨孜敬犯了罪，被处死。冬十月，根据匡复的功劳，封车骑将军刘裕为豫章郡公，抚军将军刘毅为南垩邮公，右将军何无忌为安成郡公，其余人的封赏各有等次。乙亥，任命左将军孔安国为尚书左仆射。十二月，盗贼杀死零陵太守阮野。
三年春二月己酉，车骑将军刘裕来朝见。杀东阳太守殷仲文、南峦校尉殷叔文、晋陵太守殷道叔、永嘉太守骆球。己丑，大赦，解除造酒的禁令。夏五月，大水灾。六月，姚兴部将赫连勃勃在朔方自称天王，国号夏。秋七月戊戌初一，有日食。汝南王遵之犯了罪，被处死。八月，派遣冠军将军刘敬宜持节监督征讨蜀的各种军务事宜。冬十一月，赫连勃勃大败秃发僻檀，僻檀逃奔到南山。遣一年，高云、冯跋杀死慕容熙，高云僭登皇帝位。
四年春正月甲辰，任命琅邪王德文兼任司徒，车骑将军刘裕为扬州刺史、录尚书事。庚申，侍中、太保、武陵王司马遵去世。夏四月，散骑常侍、尚书左仆射孑安国去世。甲午，加授吏部尚书孟昶为尚书左仆射。冬十一月辛卯，大风拔树。癸丑，有雷。梁州刺史杨思平犯了罪，处死后陈尸街头。当月，秃发雇檀僭登凉王位。十二月，陈留王曹灵诞去世。
五年春正月辛卯，大赦天下。庚戌，任命抚军将军刘毅为卫将军、开府仪同三司，加授辅国将军何无忌为镇南将军。戊戌，寻阳发生地震。二月，慕容超部将慕容兴宗侵犯宿豫，阳平太守刘千载、南阳太守赵元都被贼人俘虏。三月己亥，下大雪，平地雪深好几尺。车骑将军刘裕率领军队讨伐慕容超。夏六月丙寅，太庙遭雷击。刘整在临朐大破慕容超。秋七月，姚兴部将乞伏茎鳄在苑川僭称西秦王。九月戊辰，离班杀高云，高云部将冯跋攻打离班，杀了他。冯跋僭登王位，仍旧号为燕。冬十月，魏的清河王拓跋绍杀其主拓跋珪。
六年春丁亥，刘裕进攻慕容超，战胜了他，蛮地完全平定。当月，卢业刺史卢循反叛，侵犯丝业。三月，秃发侵擅在塞基和沮渠蒙逊交战，俦檀战败。壬申，镇南将军、江州刺史何无忌在豫章和卢循交战，王师战败，无忌战死。夏四月，青州刺史诸葛长民、兖州刺史刘藩、并州刺史刘道怜来保卫京师。五月丙子，刮大风，拔倒树木。戊子，卫将军刘毅在桑落洲和卢循交战，王师战败。尚书左仆射孟昶害怕，自杀。己未，大赦。乙丑，卢循到达淮口，京城内外戒严。大司马、琅邪王德文都督宫城诸军事，驻在中皇堂；太尉刘裕驻在石头，梁王珍之屯兵在南掖门，冠军将军刘敬宣屯兵在北郊，辅国将军孟怀玉屯兵在南岸，建武将军王仲德屯兵在越城，广武将军刘怀默屯兵在建阳门；淮口筑起祖浦、药园、廷尉三座营垒来抵挡敌人。丙寅，太庙屋顶的装饰建筑遭雷击。秋七月庚申，卢循逃遁。甲子，让辅国将军王仲德、广太守刘钟、河间内史蒯恩等率领部众追击。当月，卢循侵犯荆州，刺史刘道规、雍州刺史鲁宗之等打败了他。又在华容打败徐道覆，贼人再次逃往寻阳。八月，姚兴部将桓谦侵犯江陵，刘道规打败了他。冬十一月，蜀地的贼人谯纵攻陷巴束，守将温祚、时延祖战死。十二月壬辰，刘裕在豫章打败卢循。
七年春二月壬午，右将军刘藩在始兴斩了徐道覆，将首级传送到京师。夏四月，卢循逃奔交州，刺史杜慧度杀了他。秋七月丁卯，任命荆州刺史刘道规为征西大将军、开府仪同三司。冬十月，沮渠蒙逊讨伐凉，凉武昭王玄盛和他交战，打败了他。
八年春二月丙子，任命吴兴太守孔靖为尚书右仆射。三月甲寅，山阴的地面沉陷四尺，有响声像雷鸣。夏五月，乞伏公府杀乞伏干归，干归的儿子炽磐杀公府，自登伪皇帝位。六月，任命平北将军鲁宗之为镇北将军。秋七月甲午，武陵王季度去世。庚子，征西大将军刘道规去世。八月，皇后王氏去世。辛亥，高密王纯之去世。九月癸酉，将僖皇后葬在休乎陵。己卯，太尉刘裕害死右将军兖州刺史刘藩、尚书左仆射谢混。庚辰，刘裕假传诏书说：“刘毅包藏祸心，在南夏阴谋叛逆，刘藩、谢混协助叛乱，一心想犯法作乱。仰仗安邦定国的臣子们能够明察，平息危机而挫折锋锐，凶顽的叛党被铲除，社稷太平无事。爱惜生灵的德行，使承受恩德的人感激归服，赦免有罪的人而广施仁德，有助于天子恩泽的推行。况且事件由大恶人兴起，祸害出自几个元凶。特此大赦天下，惟有刘毅不在赦免的范围内。文武官员普遍提升一级。凡是孝顺忠义，隐居埋名的人，一定要向上奏报。”己丑，刘裕统领军队讨伐刘毅。刘裕的参军王镇恶攻陷江陵城，刘毅自杀。冬十一月，沮渠蒙逊僭号为河西王。十二月，任命西陵太守朱龄石为建威将军、益州刺史，统率军队讨伐蜀。从荆州分出十个郡设置湘州。这一年，庐陵、南康四次发生地震。
九年春三月丙寅，刘裕害死前将军诸葛长民和他的弟弟辅国大将军黎民、堂弟宁朔将军秀之。戊寅，加授刘裕为镇西将军、豫州刺史。林邑人范胡达侵犯九真，交州刺史杜慧度杀了他。夏四月壬戌，取消皇后在临沂、湖熟的脂泽田四十顷，用来赐给贫穷的人，放宽湖池管理的禁令。封镇北将军鲁宗之为南阳郡公。秋七月，朱龄石攻克成都，杀了谯纵，益州平定。九月，封刘裕的次子义真为桂阳公。冬十二月，安平王球之去世。这一年，高句丽、倭国和西南夷铜头大师都来进献地方特产。
十年春三月戊寅，地震。夏六月，乞伏炽磐率领军队讨伐秃发僻檀，消灭了他。秋七月，淮北大风，毁坏了茅屋房舍。九月丁巳初一，有日食。林邑国派遣使者来进献地方特产。这一年，筑束府的城墙。
十一年春正月，荆州刺史司马休之、雍州刺史鲁宗之一起举兵背叛塑龌，刘整统率军队讨伐他们。庚午，大赦。丁丑，任命吏部尚书谢裕为尚书左仆射。三月辛巳，淮陵王司马蕴去世。壬午，刘裕在江津和休之交战，休之战败，逃奔襄阳。夏四月乙卯，青、冀二州刺史刘敬宣被他的参军司马道赐杀害。五月甲申，两次出现彗星。甲午，休之、宗之出逃到姚泓那裹。根据平定蜀地的功劳，封刘裕的儿子义隆为彭城公，朱龄石为丰城公。己酉，霍山山崩，出土六只铜钟。秋七月丙戌，京师遭大水，淹坏了太庙。辛亥晦，有日食。八月丁未，尚书左仆射谢裕去世，任命尚书右仆射刘穆之为尚书左仆射。九月己亥．大赦．
十二年春正月，姚泓派他的部将鲁轨侵犯襄阳，雍州刺史赵伦之打跑了他。二月丁未，姚兴死，儿子姚泓承嗣伪位。这个月，加授刘裕为中外大都督。夏六月，赫连勃勃攻打姚泓的秦州，攻陷了它。己酉，新任尚书令、都乡亭侯刘柳去世。秋八月，刘裕和琅邪王德文统率部众讨伐姚泓。丙午，大赦。冬十月丙寅，姚泓部将姚光率洛阳城投降。己丑，派遣兼司空、高密王恢之修缮拜谒五陵。
十三年春正月甲戌初一，有日食。二月，凉武昭王李玄盛去世，世子士业继承他的地位为痉州牧、凉公。三月，龙骧将军王镇恶在潼关大破姚泓的部将姚绍。夏季，刘裕在河曲打败魏的将领鹅青，斩了鹅青的裨将阿薄干。当月，凉公奎±塞在鲜支涧大败沮渠蒙逊。五月，塑隧攻克潼关。丁亥，会稽王脩之去世。六月癸亥，林邑国进献驯象、白鹦鹉。秋季七月，刘裕攻克长安，俘虏姚泓，没收了他的彝器，送回到京师。南海贼人徐道期攻陷广州，始兴相刘谦之讨伐平息了他。冬十一月辛未，左仆射、前将军刘穆之去世．
十四年春正月辛巳，大赦。青州刺史沈田子在昼昼害死龙骧将军工堕墨。夏六月，刘整任相国，进封为宋公。冬十月，任命凉公士业为镇西将军，封为酒泉公。十一月，赫连勃勃在青泥以北大败王师。雍州刺史朱龄石焚烧长安的宫殿，逃奔到潼关。不久又大溃败，龄石因此而死。十二月戊寅，安帝在束堂去世，时年三十七。葬在休平陵。
安帝不聪慧，从小到大，都不会说话，冬夏寒暑，也不知怎么区分。凡是行动起居，都不能自理。所以桓玄篡位时，没有被杀。当初有谶语说“昌明之后有两位皇帝”，刘裕想要让司马氏禅让帝位而由自己称帝，所以秘密派遣王韶之缢死安帝而立恭帝，为的是应验谶语中的“两位皇帝”。
恭帝名德文，字德文，是安帝的同母弟弟。起初封琅邪王，历任中军将军、散骑常侍、卫将军、开府仪同三司，加授侍中，兼任司徒、录尚书六条事。元兴初，升任车骑大将军。桓玄执政后，升任太宰，加授衮衣冠冕的礼服，用绿捩绶带。桓玄篡位后，任帝为石阳县公，和安帝一起住在寻阳。到桓玄失败时，随败军到江陵。桓玄死后，桓振突然来到，跃马挥戈，直到台阶前，瞪着眼睛对安帝说：“臣一家有什么对不起国家的地方，竟然屠杀诛灭成这个样子?”帝于是走下坐床对桓振说：“逭难道是我们兄弟的意思吗!”于是桓振下马行礼。平息桓振后，再次为琅邪王。又兼任徐州刺史，不久任大司马，兼任司徒，加特殊礼遇。义熙五年，设置左右长史、司马、从事中郎共四名属官，加授羽葆和鼓吹。十二年，诏书说：“大司马昭显的德行使皇室宗亲更加盛美，太尉的道德功勋光大，全都使人伦常道美善有序，使阴阳上下谐调融合，有才俊的人引领景仰，想辅佐他料理国政。可是他平素好尚谦虚自抑，四门不开，符合大雅谦虚之道，其实违背急于求贤助世之务。从前用蒲草裹轮载送征聘来的贤人，非凡的人才就不断出现；束平开府，人才济济，朕心中想望。可以敕令二府，依照旧例召贤，必将选拔出贤德的人才，效法前辈。”于是开始选拔自己下属的官员。当时太尉刘裕都督中外诸军，有诏说：“大司马地位尊隆责任重大，亲贤没有二心。虽然他的官府受朝廷节制，他本人可以不必遵守常规来表达敬意。”刘裕北征的时候，帝向安帝上疏，请求领本部人马，登程出征前，拜谒先祖陵墓。朝廷听从了他的意见，于是和刘裕一起出发。当有关部门提出参与戎事不得拜辞陵庙时，帝再次上疏说：“臣随军离京，将经过很长时间，不能够在祖先陵墓前表达自己的情思，心中有无尽的怅惘。希望开恩，特许这一要求，使臣的诚意得以表达出来，上路便没有遗憾了。”批准了他。等到姚泓被消灭，才回到了京都。
十四年十二月戊寅，安帝去世。刘裕诈称遣诏说：“衹有我们大晋，顺应辉煌的天命，业绩统领九州，光辉庇护四海。朕因为德行不足，正逢多难之时，幸亏依靠辅政大臣，拯救了国家的颠覆。仍然凭恃着保卫佑护，战胜消除了祸乱，于是朝廷稳固，一统天下。正要凭仗辅政大臣，更新发展洪大的事业，却身染重病，看来难以痊愈。仰赖祖宗神灵的嘱咐，要将重任交付亲近贤明的人。大司马、琅邪王，是先皇骨肉，德行昭着光大，由你来当储君，是众望所归。希望你君临晋国，继承遣业，谨慎治理国家，融和天下百姓。实行我最后的告诫，不要败坏了我们高祖的伟大使命。”遣一天，登皇帝位，大赦。
元熙元年春正月壬辰初一，改年号。由于安帝还没有被安葬，不朝会。立褚氏为皇后。甲午，征召刘裕还朝。戊戌，有彗星出现在太微星垣的西边。庚申，将安皇帝葬在休平陵。帝接受朝拜，悬置乐器但不奏乐。任命骠骑将军刘道怜为司空。秋八月，刘裕迁移到寿阳镇守。任命刘怀慎为前将军、北徐州刺史，镇守彭城。九月，刘裕自动解除扬州刺史的职务。冬十月乙酉，刘裕任命他的儿子桂阳公义真为扬州刺史。十一月丁亥初一，有日食。十二月辛卯，刘裕被加授特殊礼遇。己卯，太史上奏，黑龙四次出现在东方。
二年夏六月壬戌，刘裕到达京师。傅亮秉承刘裕秘密授意，劝恭帝禅位，起草了韶书，请恭帝书写它。恭帝欣然对身边的人说：“晋氏早就失去了天下，现在又有什么遗憾。”于是用红纸书写好诏书。甲子，退位到琅邪王的府第。刘裕让恭帝当零陵王，居住在秣陵，用晋朝的纪年，车辆旗帜服饰颜色一概和他从前的一样，但实际已是有名无实。从此以后，恭帝忧虑着灾祸的降临。褚后经常在他的身边，饮食用的东西物品，都经褚后的手，所以宋人没有能够找到空子下手。宋永初二年九月丁丑，刘裕派皇后的哥哥叔度去请皇后；过了一会见，兵丁越墙进去，在内房杀了恭帝。时年三十六岁。谧号恭皇帝，葬在冲平陵。
帝幼年时性情比较残忍急躁，后来在封国时，曾经让善于射箭的入射马作为游戏。不久有人说：“马是国姓，却自己去杀马，太不吉利了。”恭帝也醒悟，非常悔恨做了遣件事。从那以后深信佛教，将成千上万的钱币铸在一起，造出一丈六尺高的铜像，亲自到瓦官寺迎接，步行随从了十多里。安帝是白痴，恭帝常常侍奉在他身边，关照冷暖起居饮食，因为恭谨而出名，当时的人们都称道这事。当初，元帝在丁丑年称晋王，立宗庙时，让郭璞占筮，说“享二百年”。从丁丑到禅代的这一年，是庚申年，正是一百零四年。但是丁丑开始有西晋，庚申就成了宋的年代，中间余下的衹有一百零二年罢了。郭璞大概因为一百零二年的期限短了，所以倒过来委婉地说成是二百年。
史臣曰：安帝即位的时期，正是紧张战乱的时期，道子、元显专权，君主昏庸而臣子乱法，这样怎能不亡国。即使手中掌握兵马，心中存念故国朝廷的人，也因回首四顾不见贤良的人，一下子就四散了。于是桓玄乘这个机会，势头超过了狂风卷地，六军都被消灭，皇帝流亡。所以宋直担并不是司马氏的臣子，瑟墨哪裹是置塑的敌寇。至于当朝而遇上颠覆，那就敷恭皇帝最不幸了。室迈之地的民众，怎会去烟熏丹穴，会稽山下的人们，难道会感叹作别人的臣民。离别了皇宫而返回旧家，写红纸诏书而不遗憾。天地间五运的更替变革，三正纪年的命数走到尽头，好比深秋时节万物凋零，是自然之理。看到晋已飘摇零落，也有人会哭泣流泪。
赞曰：安帝继承了放纵无度的国运，大盗趁势猖狂起来。恭帝暂时受命，事情由别人决定。就如保留周赧王，却是楚怀王取代。虚假的尊位和称号，不同的方法却同归于灭亡。
安皇帝名叫司马德宗，字德宗，孝武帝的大儿子。
太元十二年(387)八月十八日，立为皇太子。
太元二十一年(396)九月二十日，孝武帝死。二十一日，太子登上皇帝位，大赦天下。二十三日，任司徒、会稽王司马道子为太傅，代理政事。十月初四，把孝武皇帝安葬在隆平陵。下大雪。
隆安元年(397)正月初一，天子加冠冕，文武官员增位一等。太傅、会稽王司马道子叩头归还朝政。任尚书左仆射王繤为尚书令，领军将军王国宝为尚书左仆射。三月，吕光的将领秃发乌孤自称大都督、大单于，国号南凉。在金昌进攻吕光的将领窦苟，大破敌军。十六日，尊称皇太后李氏为太皇太后。二十日，立王氏为皇后。吕光的儿子吕纂被乞伏干归打败。吕光的建康太守段业自称凉州牧。慕容宝在蓟地打败魏国的军队。四月初七日，兖州刺史王恭、豫州刺史庾楷大兴军队，以讨伐尚书左仆射王国宝、建威将军王绪为名。十七日，朝廷杀王国宝和王绪以取得王恭的欢心，王恭才罢兵。二十一日，大赦天下。五月，先前的司徒长史王貵占据吴郡造**，王恭征讨平定了他。慕容宝的将领慕容详在中山僭位当皇帝，慕容宝逃到黄龙。八月，吕光被他的仆射杨轨、散骑常侍郎郭磛进攻，吕光的儿子吕纂打跑了他。九月，慕容宝的将领慕容麟在中山杀死慕容详，于是僭位当皇帝。十月，慕容麟被魏国的军队打败。
隆安二年二月，两只龙舟失火。五月，兰汗杀死慕容宝而自称大将军、昌黎王。七月，慕容宝的儿子慕容盛杀死兰汗，僭位称长乐王，代理天子之职。兖州刺史王恭、豫州刺史庾楷、荆州刺史殷仲堪、广州刺史桓玄、南蛮校尉杨亻全期等率兵造**。八月，江州刺史王愉逃到临川。十六日，宁朔将军邓启方与慕容德的将领慕容法在管城作战，朝廷的军队大败。二十六日，慕容盛在黄龙即皇帝位。桓玄的军队在白石把朝廷的军队打得大败。九月初二，加封太傅、会稽王司马道子黄钺仪仗。派征虏将军会稽王的大儿子司马元显、前将军王王旬、右将军谢琰征讨桓玄等人。初十，在牛渚打败庾楷。十一日，会稽王司马道子屯兵于中堂，司马元显守卫石头。二十日，前将军王王旬守卫北郊，右将军谢琰保卫宣阳门。辅国将军刘牢之驻扎在新亭，派其子刘敬宣打败王恭，王恭逃到曲阿的长塘湖，湖尉逮捕他送到京城，被斩首。于是派太常殷茂劝喻殷仲堪以及桓玄，桓玄等逃到氵寻阳。十月，新野传说出现了驺虞马。十七日，大赦天下。二十三日，殷仲堪等在寻阳结盟，推举桓玄为盟主。十一月，以琅王牙王司马德文为卫将军、开府仪同三司，领军将军王雅为尚书左仆射。十二月初二，魏王拓拔王圭即皇帝位，年号是天兴。京兆人韦礼率领襄阳的流散人众叛乱，向姚兴投降。二十二日，前新安太守杜炯在京口造**，会稽王的大儿子司马元显征讨将他杀了。秃发乌孤自称武威王。
隆安三年正月初四，封同宗室的司马蕴为淮陵王。二月十八日，河间王司马国镇死。林邑的范胡达攻陷日南、九真。于是侵犯交趾，太守杜王爰征讨打败了他。段业自称为凉王。仇池公杨盛派使称臣，献上地方物产。三月二十三日，安帝追尊生育自己的陈夫人为德皇太后。四月初十，加封尚书令王王旬为卫将军，任命会稽王大儿子司马元显为扬州刺史。六月初四，以琅王牙王司马德文为司徒。慕容德攻陷青州，杀害龙骧将军辟闾浑，于是僭位在广固称皇帝。八月，秃发乌孤死，他的弟弟秃发利鹿孤继伪位。十月，姚兴攻陷洛阳，捉住了河南太守辛恭靖。十一月初二，贼寇孙恩攻陷会稽，内史王凝之战死，吴国内史桓谦、临海太守新蔡王司马崇、义兴太守魏隐都弃官而逃，吴兴太守谢邈、永嘉太守司马逸都遇害。朝廷派卫将军谢琰、辅国将军刘牢之迎击敌寇，将他们打跑了。十二月，桓玄袭击江陵，荆州刺史殷仲堪、南蛮校尉杨亻全期都遇害。吕光立他的儿子吕绍为天王，自称为太上皇。这一天，吕光死，吕纂杀吕绍而自立为天王。这一年，荆州发大水，平地水深三丈。
隆安四年正月二十四日，大赦天下。二月初八，彗星侵犯奎娄星座，进入到紫微座。三月，彗星在太微星座出现。四月，地震。孙恩侵犯浃口。五月十七日，散骑常侍、卫将军、东亭侯王繤死。三十日，会稽内史谢琰被孙恩打败并战死。孙恩接着进犯临海。六月初一，有日蚀。大旱。辅国司马刘裕在南山打败孙恩。孙恩的将领卢循攻陷广陵，杀死三千多人。任琅王牙王的老师何澄为尚书左仆射。七月初四，太皇太后李氏死。十九日，大赦天下。这个月，姚兴讨伐乞伏干归，乞伏干归投降。八月初九，尚书右仆射王雅死。二十四日，将文太后葬在修平陵。九月初六，发生地震。十一月，宁朔将军高雅之与孙恩在余姚作战，朝廷的军队失败。任扬州刺史元显为后将军、开府仪同三司、都督扬、豫、徐、兖、青、幽、冀、并、荆、江、司、雍、梁、益、交、广十六州诸军事，前将军刘牢之为镇北将军，封元显的儿子彦璋为东海王。十二月初二，彗星侵入天市座。这一年，河右各郡推崇凉武昭王李玄盛为秦、凉二州牧、凉公，年号为庚子。
隆安五年二月初一，孙恩又进犯浃口。吕超杀死吕纂，让他的哥哥吕隆僭位当天王。三月初九，众星经过太微星向西流动。五月，孙恩进犯沪渎，吴国内史袁山松战死。沮渠蒙逊杀死段业，自称大都督、北凉州牧。六月初一，孙恩到丹徒。初二，朝廷内外戒严，百官到禁中居住。冠军将军高素、右卫将军张崇之守卫石头，辅国将军刘袭用栅栏隔断淮口，丹扬尹司马恢之戍守南岸，冠军将军桓谦、辅国将军司马允之、游击将军毛遂守备白石，左卫将军王嘏、领军将军孔安国驻扎在中皇堂。征召豫州刺史、谯王司马尚之保卫京城。宁朔将军高雅之在广陵的郁洲进攻孙恩，被孙恩捉住。七月，段玑杀慕容盛，慕容盛的叔父慕容熙诛灭段氏家族，于是僭位称皇帝。九月，吕隆向姚兴投降。十月，姚兴率军队侵犯魏国，大败而还。这一年，天下大饥，禁止饮酒。
元兴元年(402)正月初一，大赦天下，改变年号。任命后将军元显为骠骑大将军、征讨大都督，镇北大将军刘牢之为元显前锋，前将军、谯王司马尚之为后部，以讨伐桓玄。二月初七，天子穿战服在西池为元显饯行。十八日，派兼侍中、齐王司马柔之用驺虞幡帜向荆州、江州宣告。二十八日，桓玄在姑孰打败朝廷的军队，谯王司马尚之、齐王司马柔之都战死。又任右将军吴隐之为都督交、广二州诸军事、广州刺史。三月初一，刘牢之背叛朝廷向桓玄投降。初三，朝廷的军队在新亭战败，骠骑大将军、会稽王的大儿子司马元显，东海王司马彦璋，冠军将军毛泰，游击将军毛邃都遇害。初四，桓玄自称为侍中、丞相、录尚书事，以桓谦为尚书令，把太傅、会稽王司马道子迁到安城。不久，桓玄又自称太尉、扬州牧，总理各种机要政事，任琅笽王司马德文为太宰。临海太守辛景进攻孙恩并将他斩首。这个月，秃发利鹿孤死，其弟亻辱檀继承伪位。七月初八，新蔡王司马崇被他的奴仆杀害。八月初四，尚书的私宅遭火灾。十月，冀州刺史刘轨背叛朝廷投靠慕容德。十二月二十六日，会稽王司马道子被桓玄杀害。特赦广陵、彭城两地大逆罪以下的犯人。
元兴二年二月初八，建威将军刘裕在东阳打败徐道覆。二十二日，桓玄自称为大将军。二十四日，冀州刺史孙无终被桓玄杀害。四月初一，出现日蚀。八月，桓玄又自称为相国、楚王。九月，南阳太守庾仄兴起义兵，被桓玄打败。十一月二十三日，桓玄把安帝迁到永安宫。二十四日，把太庙的祖宗牌位移到琅王牙国。十二月初三，桓玄篡夺帝位，让安帝当平固王。二十二日，安帝逃亡到浔阳，蒙受风尘。
元兴三年二月，安帝在浔阳。初二的夜晚，洪水进入石头城，冲走了居民和房屋。二十七日，建武将军刘裕率领沛国的刘毅、东海的何无忌等兴起义兵。二十八日，将桓玄所委任的徐州刺史桓修杀死在京口，青州刺史桓弘杀死在广陵。二十九日，义兵渡过长江。三月初一，刘裕在江乘将桓玄的将领吴甫之斩首，在罗落把皇甫敷斩首。初二，桓玄的徒众溃散逃命。初三，刘裕设置留守京师的百官和机构。初五，桓玄的司徒王谧推举刘裕当镇军将军、徐州刺史、都督扬、徐、兖、豫、青、幽、并八州诸军事、假节。刘裕任王谧领扬州刺史、录尚书事。初四，刘裕诛杀尚书左仆射王愉，以及王愉的儿子荆州刺史王绥、司州刺史温详。十四，桓玄逼安帝西上。二十九日，安帝下密诏，因被桓玄幽禁威逼，朝政空旷，令武陵王司马遵依照旧典，继承帝制总领百官行事，加封为侍中，其余官职如故。并且大赦谋反叛逆之人，只有与桓玄同一祖宗的家族不宽宥。四月初二，大将军、武陵王司马遵称帝制，总理万机。初三，安帝到江陵。二十三日，辅国将军何无忌、振武将军刘道规与桓玄的将领庾稚、何淡之在湓口交战，大破敌军。桓玄又逼迫安帝东下。五月十七日，冠军将军刘毅与桓玄在峥嵘洲作战，又大破桓玄的军队。二十三日，安帝又到江陵。二十五日，荆州别驾王康产、南郡太守王腾之保护安帝在南郡居住。二十六日，督护冯迁在貊盘洲把桓玄斩首。车马返回到江陵。二十八日，下诏说：“奸凶篡夺帝位叛逆，自古有之。我不能防微杜渐，以致流离失所，仰仗镇军将军刘裕的英雄谋略奋发，忠心义胆绝世，冠军将军刘毅等诚心一向显著，齐心协力。仁义之声显扬，士人百姓报效国家，社稷得以平安，天下得以同庆。现大赦天下，所有被威势逼迫屈从逆贼之命的人，一律不问罪。”二十二日，供奉祖宗牌位进入太庙。闰五月初三，桓玄的故将扬武将军桓振攻陷江陵，刘毅、何无忌退守氵寻阳，安帝又在贼营中蒙受风尘。六月，益州刺史毛璩讨伐伪梁州刺史桓希，将他斩首。七月二十三日，永安皇后何氏死。八月十九日，把穆帝章皇后合葬在永平陵。九月，以前的给事中刁骋、秘书丞王迈之谋反，遭到诛杀。十月，卢循侵犯广州，刺史吴隐之被卢循打败，捉住了始兴相阮腆之才退去。慕容德死，他哥哥的儿子慕容超继承伪位。
义熙元年(405)正月，安帝在江陵。南阳太守鲁宗之兴起义兵，攻破襄阳。初七，刘毅驻扎在马头。桓振拥戴安帝屯兵于江津。初九，鲁宗之在柞溪打败桓振的将领温楷，进兵驻扎在纪南，被桓振打败。振武将军刘道规进攻桓谦，将他赶跑。天子复位，安帝与琅王牙王乘坐刘道规的船。十六日，诏书说：“朕因少德，早继宏业。不能使远近和睦，遏止奸宄。叛逆之臣桓玄乘机作乱，竟欺骗上天和人民，篡夺帝位。我自身流离失所，沦落蛮荒之地，宣武皇帝的基业，顷刻间坠毁。仰仗镇军将军刘裕忠武英明果断，诚心古来第一。运筹谋划机宜，忠贞贤臣齐心协力；擦干眼泪当众盟誓，义士为诚心感动。所以刀枪一挥，巨贼奔窜，三军振作威风，元凶献出首级。其余孽桓振猖狂，接着在荆郢逞凶。幸赖上天赐福社稷，义兵举旗，再传捷报，贼寇崩溃，我才能复位。此实赖宗庙之灵验，众将勤王之功勋。哪能我一人独享此福..呢？我想与万民从此重新开始，大赦天下，改年号，只有桓玄桓振一族以及他们的同党不在宽宥之列。赐百官爵位每人二级，鳏寡孤独每人五斛谷，大设酒宴五日。”二月初五，留守京师的官员备好车马法驾仪仗，到江陵迎接安帝。弘农太守戴宁之，建威主簿徐惠子等人谋反，遭诛杀。平西参军谯纵杀害平西将军、益州刺史毛璩，率蜀郡叛乱。三月，桓振又袭击江陵，荆州刺史司马休之逃到襄阳。建威将军刘怀肃讨伐桓振并将他斩首。安帝从江陵回京。十四日，百官到宫廷请罪。下诏说：“这不是众卿的过失，大家回去尽心职事。”十七日，为章皇后哀丧三天，在西堂哭丧吊唁。刘裕与何无忌等上奏章请求让位，不允许。十九日，以琅王牙王司马德文为大司马，武陵王司马遵为太保，加封镇军将军刘裕为侍中、车骑将军、都督中外诸军事。二十三日，下诏说：“近来国难之后，人民财物凋零残破，平常所供奉的东西，还没有改变旧制，这难道符合视人如伤，夏禹商汤归过于己的训诫吗？可酌情减省。”四月，刘裕回到京口镇守。十七日，天子在东堂为他饯行。五月初三，禁止制作绢面的扇子和扌雩蒲的博戏。游击将军、章武王司马秀，益州刺史司马轨之谋反，被诛杀。桓玄的故将桓亮、苻宏、刁预侵犯湘州，守将把他们打败。八月十五日，封临川王的儿子司马修之为会稽王。十一月，乞伏干归讨伐仇池，仇池公杨盛把他打得大败。这一年，凉武昭王玄盛派使奉表称臣。
义熙二年正月，益州刺史司马荣期在白帝城进攻谯纵的将领谯子明，大败敌军。五月，封高密王的儿子法莲为高阳王。七月，梁州刺史杨孜敬有罪，被诛杀。十月，论定匡复社稷的功劳，封车骑将军刘裕为豫章郡公，抚军将军刘毅为南平郡公，右将军何无忌为安成郡公，其余封赏各有等差。十一月初三，以左将军孔安国为尚书左仆射。十二月，盗寇杀死零陵太守阮野。
义熙三年二月初九，车骑将军刘裕前来朝拜。诛杀东阳太守殷仲文、南蛮校尉殷叔文、晋陵太守殷道叔、永嘉太守骆球。闰二月十九日，大赦天下，解除禁酒令。五月，发大水。六月，姚兴的将领赫连勃勃在朔方僭位称天王，国号为夏。七月初一，有日蚀。汝南王司马遵之有罪，被诛杀。八月，派冠军将军刘敬宣持节监督征讨蜀地诸军事。十一月，赫连勃勃大败秃发亻辱檀，秃发亻辱檀逃到南山。这一年，高云、冯跋杀死慕容熙。高云僭位为皇帝。
义熙四年正月初九，以琅王牙王司马德文领司徒之职，车骑将军刘裕为扬州刺史、录尚书事。二十五日，侍中、太保、武陵王司马遵死。四月，散骑常侍、尚书左仆射孔安国死。五月初一，加封吏部尚书孟昶为尚书左仆射。十一月初一，大风拔起树木。二十三日，雷鸣。梁州刺史杨思平有罪，斩首弃市。这个月，秃发亻辱檀僭位当凉王。十二月，陈留王曹灵诞死。
义熙五年正月初二，大赦天下。二十一日，任抚军将军刘毅为卫将军、开府仪同三司，加封辅国将军何无忌为镇南将军。十九日，寻阳发生地震。二月，慕容超的将领慕容兴宗侵犯宿豫，阳平太守刘千载、济南太守赵元都被贼兵捉住。三月十一日，下大雪，积雪有几尺厚。车骑将军刘裕率领军队进攻慕容超。六月初九，太庙发生地震。刘裕在临朐把慕容超打得大败。七月，姚兴的将领乞伏干归在苑川僭位称西秦王。十月十三日，离班杀死高云，高云的将领冯跋攻击离班，将离班杀死。冯跋僭位称王，国号仍然叫燕。魏国的清河王拓跋绍杀死拓跋王圭。
义熙六年二月初五，刘裕进攻慕容超，战胜了他，齐地全部平定。这个月，广州刺史卢循谋反，侵犯江州。三月，秃发侵擅在塞基和沮渠蒙逊交战，侵擅战败。。二十日，镇南将军、江州刺史何无忌与卢循在豫章交战，朝廷的军队战败，何无忌战死。四月，青州刺史诸葛长民、兖州刺史刘藩、并州刺史刘道怜入京保卫京师。五月二十五日，刮大风，拔起树木。初五日，卫将军刘毅与卢循在桑落洲交战，朝廷的军队大败。尚书左仆射孟昶因害怕而自杀。初六，大赦天下。十二日，卢循到淮口，内外戒严。大司马、琅邪王司马德文都督宫城诸军事，驻军中皇堂，太尉刘裕驻扎在石头，梁王司马珍之屯兵南掖门，冠军将军刘敬宣屯兵北郊，辅国将军孟怀玉屯兵南岸，建武将军王仲德屯兵越城，广武将军刘怀默屯兵建阳门，在淮口筑起相浦、药园、廷尉三个营垒以抵御敌军。七月初十，卢循逃走。十四日，派辅国将军王仲德、广川太守刘钟、河间内史蒯恩等率兵追赶。这个月，卢循侵犯荆州，刺史刘道规、雍州刺史鲁宗之等人击败了他。又在华容攻破徐道覆，贼兵又逃到寻阳。八月，姚兴的将领桓谦侵犯江陵，刘道规打败了他。十一月，蜀地贼将谯纵攻陷巴东，守将温祚、时延祖战死。十二月十四日，刘裕在豫章打败卢循。
义熙七年二月初五，右将军刘藩在始兴将徐道覆斩首，首级传到京师。四月，卢循逃到交州，刺史杜彗度将他斩首。七月二十三，任荆州刺史刘道规为征西大将军、开府仪同三司。十月，沮渠蒙逊进攻凉国，凉国武昭王玄盛与他交战，打败了他。
义熙八年二月初五，任吴兴太守孔靖为尚书右仆射。三月十三日，山阴有的地方塌陷四尺，响声如雷。五月，乞伏公府杀死乞伏干归，乞伏干归的儿子炽盘诛杀乞伏公府，僭位任伪职。六月，任平北将军鲁宗之为镇北将军。七月二十六日，武陵王司马季度死。八月初二，征西大将军刘道规病死。皇后王氏也病死。十三日，高密王司马纯之病死。九月初六，把僖皇后安葬在休平陵。十二日，太尉刘裕害死右将军兖州刺史刘藩、尚书左仆射谢混。十三日，刘裕假托诏书说：“刘毅包藏祸心，勾结南夏叛逆，刘藩、谢混共同作乱，放肆地图谋作乱，仰仗辅佐明鉴，乘机挫锐势，凶党已遭杀戮，社稷长治久安。好生之德是所依据的根本，宽赦罪人延及仁德，确实有助圣恩，何况事端由首恶之人兴起，灾祸起自元凶。大赦天下，只有刘毅不在其例。文武百官普遍增爵位一等。那些孝顺忠义，隐遁遗逸的贤士，一定要让他们显名声，受重用。”二十二日，刘裕率兵讨伐刘毅。刘裕的参军王镇恶攻陷江陵城，刘毅自杀。十一月，沮渠蒙逊僭号为河西王。十二月，任西陵太守朱龄石为建威将军、益州刺史，率军队进攻蜀。从荆州分出十郡设置一个湘州。这一年，庐陵、南康两地发生四次地震。
义熙九年三月初一，刘裕杀害前将军诸葛长民以及他的弟弟辅国大将军诸葛黎民、堂兄弟宁朔将军诸葛秀之。十三日，加封刘裕为镇西将军、豫州刺史。林邑的范胡达侵犯九真，交州刺史杜彗度把他斩首。四月初四，罢除临沂、湖熟皇后四十顷脂泽田，赐给贫民，放松对湖泊池沼的禁令。封镇增强将军鲁宗之为南阳郡公。七月，朱龄石攻克成都，把谯纵斩首，益州平定。九月，封刘裕的第二个儿子刘义真为桂阳公。这一年，高句丽、倭国以及西南夷铜头大师都进贡地方物产。
义熙十年三月十九日，发生地震。六月，乞伏炽盘率军队讨伐秃发亻辱檀，将他消灭。七月，淮北刮大风，毁坏房屋。九月初一，有日蚀出现。林邑派使者进献地方物产。这一年，在东府筑城墙。
义熙十一年(415)正月，荆州刺史司马休之，雍州刺史鲁宗之都率兵暗暗背叛刘裕，刘裕率军队讨伐他们。十六日，大赦天下。二十三日，任吏部尚书谢裕为尚书左仆射。三月二十八日，淮陵王司马蕴死。二十九日，刘裕与司马休之在江津交战，司马休之战败，逃到襄阳。四月初三，青、冀二州刺史刘敬宣被他的参军司马道赐杀害。五月初二，彗星两次出现。十二日，司马休之、鲁宗之投靠姚兴。朝廷论定平蜀的功劳，封刘裕的儿子刘义隆为彭城公，朱龄石为丰城公。二十七日，霍山崩塌，发现六枚铜钟。七月初五，京城发大水，冲坏太庙。三十日傍晚，出现日蚀。八月，尚书左仆射谢裕死，以尚书右仆射刘穆之为尚书左仆射。九月十九，大赦天下。
义熙十二年正月，姚泓派他的将领鲁轨侵犯襄阳，雍州刺史赵伦之将他赶跑。二月，加封刘裕为中外大都督。六月，赫连勃勃在秦州进攻姚泓，攻陷城池。初三，新任尚书令、都乡亭侯刘柳死。八月，刘裕同琅王牙王司马德文率众兵讨伐姚泓。初一，大赦天下。十月二十二日，姚泓的将领姚光献洛阳投降。十一月十六日，派兼司空、高密王司马恢之修治拜谒五陵。
义熙十三年正月初一，出现日食。二月，凉武昭王李玄盛死，他的大儿子李士业继位为凉州牧、凉公。三月，龙骧将军王镇恶在潼关把姚泓的将领姚绍打得大败。四月，刘裕在河曲打败魏将鹅青，将鹅青的偏将阿薄干斩首。这个月，凉公李士业在鲜支涧把沮渠蒙逊打得大败。五月，刘裕攻克潼关。十六日，会稽王司马修之死。六月二十三日，林邑进献驯服过的大象和白鹦鹉。七月，刘裕攻克长安，活捉姚泓，没收他的仪仗器物，回到京师。南海盗贼徐道期攻陷广州，始兴相刘谦之将他平定。十一月初三，左仆射、前将军刘穆之死。
义熙十四年正月，大赦天下。青州刺史沈田子在长安杀害龙骧将军王镇恶。六月，刘裕任相国，晋封为宋公。十月，任凉公李士业为镇西将军，封为酒泉公。十一月，赫连勃勃在青泥以北打败朝廷军队。雍州刺史朱龄石焚烧长安的宫殿，逃到潼关。不久又大败，朱龄石战死。十二月十七日，安帝死在东堂，享年三十七岁。安葬在休平陵。安帝智力低下，从小到大，口不能言语，即使寒暑节气的变化，他也无法辨别。一切行动，都不出于他自己。所以桓玄篡位，他免于被害。当初的谶书上说：“昌明帝之后有两个皇帝。”刘裕打算受禅代晋，所以秘密地派王绍之勒死安帝另立恭帝，以顺应二帝之说。
恭帝名德文，字德文，是安帝的同母弟。初封琅王牙王，历任中军将军、散骑常侍、卫将军、开府仪同三司，加侍中、领司徒、录尚书六条事。
安帝元兴初年(402～404)，迁为车骑大将军。桓玄执政时，进位为太宰，加衮冕之服，用绿色印带。桓玄篡位，以帝为石阳县公，与安帝一起住在寻阳。桓玄失败后随桓玄到江陵。桓玄被杀，桓振突然来到，跃马挥戈，直至阶下，瞋目对安帝说：“我桓家有何对不起国家，而遭如此屠灭？”恭帝下床对桓振说：“这怎是我兄弟之意呢！”桓振这才下马拜谢。桓振被平定，帝仍为琅王牙王，又兼徐州刺史，不久拜为大司马，兼司徒，受到特殊礼遇。安帝义熙五年(409)，署中设置左右长史、司马、从事中朗四人，加赐羽葆鼓吹。
义熙十二年(416)，皇帝下诏说：“大司马有明德而又为宗室之亲，太尉德高而功大，使人伦有序，阴阳协和，俊才仰慕，思佐国家。而二人高雅冲淡，不愿设置征士，这样符合大雅谦虚之道，却有违荐贤治世的当务之急。昔日贤君以蒲轮征召才秀之士，而异人辈出，东平开府设署，而奇士响应，人才济济，朕甚钦慕。可使大司马、太尉二府照旧例征召人才，必使俊杰之士得以显扬，继前贤之规范。”于是恭帝始征召掾属。当时太尉刘裕都督中外诸军，皇帝下诏说：“大司马位高任重，论亲论贤，皆莫可比，虽官府要受他人节制，个人不必行下级之礼。”刘裕北征时，恭帝向安帝上疏，请率所属军队，同上征途，以修整祭祀旧都陵墓，朝廷同意此请求，于是与刘裕一起出征。有司奏军人不得料理陵庙之事，恭帝又上疏说：“臣率军在外，将经历寒暑，不能在先帝陵前表祭奠哀悼之情，心绪茫然若失。愿圣上发慈悲之心，特予许可，使臣区区诚心粗略得以实现。则此次出征无所遗憾了。”皇帝答应了这个请求，姚泓被灭后回到京都。
义熙十四年(418)十二月十六日，安帝死。刘裕假称遗诏说：“我晋顺应天命，兴隆于九州，光照四海，朕因德薄，国家多难，幸赖宰辅之臣，拯救颠覆。仍恃神明保佑，克服祸乱，才保持皇极之位，统一六合。正将依赖元勋革新大业，而疾病渐重，将不能恢复，仰思祖宗亲贤之遗命，大司马、琅王牙王，为先皇亲子，明德茂美，亦为皇储，众望所归，今可即皇帝位，奉宗庙之祀，谨守中道，协和天下，发扬临终诰命，不要废弃我高祖之大业。”当天即皇帝位，实行大赦。
元熙元年(419)正月初一，改年号。因安帝葬事未妥，不朝会，立褚氏为皇后。初三，召刘裕还朝。初七，有彗星出现于太微星西边。二十九日葬安帝于休平陵。恭帝受群臣朝拜，乐器悬而不奏。以骠骑将军刘道怜为司空。秋八月，刘裕移镇寿阳。以刘怀慎为前将军、北徐州刺史，镇守彭城。九月，刘裕自己解去扬州的职务。冬十月二十八日，刘裕以其子刘义真为扬州刺史。十一月初一，日蚀。十二月辛卯这天，给裕加特殊礼遇。
元熙二年(420)夏六月初九，刘裕回到京师。傅亮受刘裕密旨，劝恭帝禅位于刘裕，起草了诏书，让恭帝抄写。恭帝欣然对左右的人说：“晋氏的权柄早已丧失，今天又有何恨。”就用赤纸写了诏书。十一日，退位回到琅王牙王府第。刘裕封恭帝为零陵王，居住在秣陵，使用晋的历法，车骑服色不改，只是不行天子之礼。从此之后，恭帝深虑灾祸到来，褚皇后常在身边，饮食用品都由褚皇后经手，故宋人无机会下手。
宋武帝永初二年(421)九月丁丑这天，刘裕使褚后兄褚叔度请褚后，有了机会，武士越墙而入，将恭帝杀死在内房，终年三十六岁。谥号恭皇帝。葬于冲平陵。恭帝幼时性格残忍而暴躁，到封国以后，曾使善射者射马作游戏。事后有人说：“马是国君之姓，而自己射死马，这是很不吉祥的。”恭帝也感悟到这一点，很后悔。以后又笃信佛教，用成千上万的钱币，铸成丈六金像，亲自在瓦官寺迎接，步行十几里。安帝智力低下，恭帝常在左右伺候，调解冷暖饮食作息，以恭谨闻名，受到人们的称赞。南渡开始，元帝在丁丑年(317)称晋王，建立宗庙，使郭璞占卜，说：“享有天下二百年。”禅位那年是庚申年(420)，从丁丑到庚申为一百零四年。而丁丑年仍属西晋，庚申年算在宋朝，只剩下一百零二年。郭璞大概认为一百零二年太短促，故意将数字颠倒过来，含蓄地说成二百年。
恭帝名德文，字德文，是安帝的同母弟。初封琅王牙王，历任中军将军、散骑常侍、卫将军、开府仪同三司，加侍中、领司徒、录尚书六条事。
安帝元兴初年(402～404)，迁为车骑大将军。桓玄执政时，进位为太宰，加衮冕之服，用绿色印带。桓玄篡位，以帝为石阳县公，与安帝一起住在寻阳。桓玄失败后随桓玄到江陵。桓玄被杀，桓振突然来到，跃马挥戈，直至阶下，瞋目对安帝说：“我桓家有何对不起国家，而遭如此屠灭？”恭帝下床对桓振说：“这怎是我兄弟之意呢！”桓振这才下马拜谢。桓振被平定，帝仍为琅王牙王，又兼徐州刺史，不久拜为大司马，兼司徒，受到特殊礼遇。安帝义熙五年(409)，署中设置左右长史、司马、从事中朗四人，加赐羽葆鼓吹。
义熙十二年(416)，皇帝下诏说：“大司马有明德而又为宗室之亲，太尉德高而功大，使人伦有序，阴阳协和，俊才仰慕，思佐国家。而二人高雅冲淡，不愿设置征士，这样符合大雅谦虚之道，却有违荐贤治世的当务之急。昔日贤君以蒲轮征召才秀之士，而异人辈出，东平开府设署，而奇士响应，人才济济，朕甚钦慕。可使大司马、太尉二府照旧例征召人才，必使俊杰之士得以显扬，继前贤之规范。”于是恭帝始征召掾属。当时太尉刘裕都督中外诸军，皇帝下诏说：“大司马位高任重，论亲论贤，皆莫可比，虽官府要受他人节制，个人不必行下级之礼。”刘裕北征时，恭帝向安帝上疏，请率所属军队，同上征途，以修整祭祀旧都陵墓，朝廷同意此请求，于是与刘裕一起出征。有司奏军人不得料理陵庙之事，恭帝又上疏说：“臣率军在外，将经历寒暑，不能在先帝陵前表祭奠哀悼之情，心绪茫然若失。愿圣上发慈悲之心，特予许可，使臣区区诚心粗略得以实现。则此次出征无所遗憾了。”皇帝答应了这个请求，姚泓被灭后回到京都。
义熙十四年(418)十二月十六日，安帝死。刘裕假称遗诏说：“我晋顺应天命，兴隆于九州，光照四海，朕因德薄，国家多难，幸赖宰辅之臣，拯救颠覆。仍恃神明保佑，克服祸乱，才保持皇极之位，统一六合。正将依赖元勋革新大业，而疾病渐重，将不能恢复，仰思祖宗亲贤之遗命，大司马、琅王牙王，为先皇亲子，明德茂美，亦为皇储，众望所归，今可即皇帝位，奉宗庙之祀，谨守中道，协和天下，发扬临终诰命，不要废弃我高祖之大业。”当天即皇帝位，实行大赦。
元熙元年(419)正月初一，改年号。因安帝葬事未妥，不朝会，立褚氏为皇后。初三，召刘裕还朝。初七，有彗星出现于太微星西边。二十九日葬安帝于休平陵。恭帝受群臣朝拜，乐器悬而不奏。以骠骑将军刘道怜为司空。秋八月，刘裕移镇寿阳。以刘怀慎为前将军、北徐州刺史，镇守彭城。九月，刘裕自己解去扬州的职务。冬十月二十八日，刘裕以其子刘义真为扬州刺史。十一月初一，日蚀。十二月辛卯这天，给裕加特殊礼遇。
元熙二年(420)夏六月初九，刘裕回到京师。傅亮受刘裕密旨，劝恭帝禅位于刘裕，起草了诏书，让恭帝抄写。恭帝欣然对左右的人说：“晋氏的权柄早已丧失，今天又有何恨。”就用赤纸写了诏书。十一日，退位回到琅王牙王府第。刘裕封恭帝为零陵王，居住在秣陵，使用晋的历法，车骑服色不改，只是不行天子之礼。从此之后，恭帝深虑灾祸到来，褚皇后常在身边，饮食用品都由褚皇后经手，故宋人无机会下手。
宋武帝永初二年(421)九月丁丑这天，刘裕使褚后兄褚叔度请褚后，有了机会，武士越墙而入，将恭帝杀死在内房，终年三十六岁。谥号恭皇帝。葬于冲平陵。恭帝幼时性格残忍而暴躁，到封国以后，曾使善射者射马作游戏。事后有人说：“马是国君之姓，而自己射死马，这是很不吉祥的。”恭帝也感悟到这一点，很后悔。以后又笃信佛教，用成千上万的钱币，铸成丈六金像，亲自在瓦官寺迎接，步行十几里。安帝智力低下，恭帝常在左右伺候，调解冷暖饮食作息，以恭谨闻名，受到人们的称赞。南渡开始，元帝在丁丑年(317)称晋王，建立宗庙，使郭璞占卜，说：“享有天下二百年。”禅位那年是庚申年(420)，从丁丑到庚申为一百零四年。而丁丑年仍属西晋，庚申年算在宋朝，只剩下一百零二年。郭璞大概认为一百零二年太短促，故意将数字颠倒过来，含蓄地说成二百年。
史臣曰：安帝即位的时期，正是紧张战乱的时期，道子、元显专权，君主昏庸而臣子乱法，这样怎能不亡国。即使手中掌握兵马，心中存念故国朝廷的人，也因回首四顾不见贤良的人，一下子就四散了。于是桓玄乘这个机会，势头超过了狂风卷地，六军都被消灭，皇帝流亡。所以宋直担并不是司马氏的臣子，瑟墨哪裹是置塑的敌寇。至于当朝而遇上颠覆，那就敷恭皇帝最不幸了。室迈之地的民众，怎会去烟熏丹穴，会稽山下的人们，难道会感叹作别人的臣民。离别了皇宫而返回旧家，写红纸诏书而不遗憾。天地间五运的更替变革，三正纪年的命数走到尽头，好比深秋时节万物凋零，是自然之理。看到晋已飘摇零落，也有人会哭泣流泪。
赞曰：安帝继承了放纵无度的国运，大盗趁势猖狂起来。恭帝暂时受命，事情由别人决定。就如保留周赧王，却是楚怀王取代。虚假的尊位和称号，不同的方法却同归于灭亡。
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