Linux系统基础教程：新手入门必看指南

大家好，今天来为大家解答Linux系统基础教程：新手入门必看指南这个问题的一些问题点，包括也一样很多人还不知道，因此呢，今天就来为大家分析分析，现在让我们一起来看看吧！如果解决了您的问题，还望您关注下本站哦，谢谢~

如上图所示，是服务端的抽象框架。作为用户，我们不需要理解得那么清楚。我们只需要知道，在使用服务器时，我们使用一个名为shell的命令接口应用程序来指示服务器工作。 shell的类型有很多种，最常用的有sh、bash等，其中又以bash最为常见。无需担心shell 的类型，就像您可以使用Office Word 代替WPS 仍然可以编辑文档一样。

与您自己的计算机相比，服务器是远程资源。如果要使用的话，必须用俗称终端的软件登录才能使用服务器中的所有资源。此类软件有很多，您可以选择。之前介绍过一款终端软件。您可以参考：MobaXterm：强大的终端。登录后，你就可以遨游服务器的世界了。

命令使用

在服务器中，所有的操作都必须通过相应的命令来完成。以下是一些文件操作中常用的命令：

基本命令pwd：获取当前路径

ls：查看目录内容

cd：切换工作目录

head：查看文件前N行内容

tail：查看文件后前N行内容

cat：查看文件内容

less：以交互方式查看文件。由于是交互式查看，所以需要使用q来停止查看。

触摸：创建文件

mkdir：创建目录

cp：复制文件或目录

mv：移动或重命名文件和目录

ln: 创建链接

find：搜索文件和目录

排序：文件排序

rm：删除文件或目录

文件处理awk：文件内容的增删改查

sed：添加、删除、修改和检查文件内容

grep：文件内容的匹配

脚本编辑vim：Linux系统自带的文本编辑器，可以用来编辑shell脚本。对于初学者来说门槛有点高。另外，请注意不要使用此命令打开非常大的文件。命令的使用这里不再详细介绍。毕竟每个命令不能用一两句话来使用，尤其是awk、sed、grep等可以用来处理文件的命令。前面介绍过如何使用awk进行文件去重。您可以参考：文件去重：awk的高级用法。 Linux中有很多命令。以基本命令为例。我们不需要记住每个命令的详细用法。我们只需要知道谁应该完成指定的操作。使用时可以使用具体方法的详细帮助文档。这实在是不可能的。您可以在书籍或在线中找到示例教程。

在Linux 中获取命令帮助有两种方法。一种是通过命令附带的帮助选项，例如-h、--help；另一种是通过man help 命令。

命令的帮助选项

适用于带有有用选项的命令，例如以下mkdir 命令。可以使用--help帮助选项查看命令所有选项的详细介绍：mkdir --help

用法： mkdir [选项].目录.

创建目录（如果尚不存在）。

长期权的强制性参数对于短期权也是强制性的。

-m, --mode=MODE 设置文件模式（如chmod），而不是a=rwx - umask

-p, --parents 如果存在则没有错误，根据需要创建父目录

-v, --verbose 为每个创建的目录打印一条消息

-Z 设置每个创建目录的SELinux 安全上下文

为默认类型

--context[=CTX] 与-Z 类似，或者如果指定了CTX，则设置SELinux

或SMACK 安全上下文到CTX

--help 显示此帮助并退出

--version 输出版本信息并退出

GNU coreutils 在线帮助：将mkdir 翻译错误报告到完整文档at: 或通过本地可用： info "(coreutils) mkdir invoice"man help 命令

适用于所有命令。有些命令没有帮助选项。您可以通过这种方式查看帮助。记住以字母q 结尾：man mkdir。结果如下：

文件路径

在Windows系统中打开文件时，似乎忽略了路径的概念。这是因为基于视觉操作的反馈淡化了路径的存在。事实上，Windows中文件也存储在不同的文件夹中。与Windows相比，路径在Linux系统中非常重要，因为它会直接影响命令是否可以找到文件。有这么一句话，linux里面一切皆文件，这些文件是怎么存储的呢？

普通文件通过特殊的文件（文件夹）以层次结构存储。这种层次结构就形成了所谓的路径，类似下图：

文件路径的作用应该很好理解。目的是找到需要处理的具体文件。也可以避免同名文件的尴尬。例如，如果不同文件夹中有两个同名文件，则可以通过路径指定具体文件。因此，在Linux中处理文件时，需要添加路径。也许这个时候就会有人说是吧？该命令处理文件时，不需要在文件名前面添加路径。不加路径其实只是一种掩饰，一种特殊的情况，即该文件恰好存在于执行命令时shell所在的目录中（此时的目录有一个专业的名字叫工作目录或者当前目录），英文缩写为WD，可以使用pwd命令查看。工作目录的概念很重要。）当前路径的写法省略。为了方便起见，可以省略当前路径./符号，这会造成没有路径的错觉。

所以，再次强调一下，在Linux中使用文件时，必须有路径，只是提供的方式不同。根据目录的起始点，可以分为绝对路径和相对路径。绝对路径从/根目录开始，后面跟着各层的目录名，直到文件末尾。格式如/path1/path2/path3/file.txt，任何时候用这种方法都不会出现问题；相对目录根据出发点不同可分为当前目录、上级目录、主目录三种情况，分别用符号.~表示。其中前两个第一个是相对于工作路径而言，后者是无论如何起始点都是主目录（即登录终端的目录）。既然绝对路径绝对没有问题，为什么还要使用相对路径呢？原因很简单，人性化的设置，一般绝对路径很长，相对路径很短，在使用过程中非常方便。感觉就像偷工减料！

绝对路径很容易理解。相对路径的概念听起来很抽象，并且可能有点令人困惑。如果结合实际操作会更容易消化。

结束语

Linux毕竟也是计算机，但由于交互方式的变化，使用上存在差异，需要一个缓慢的适应过程。一旦习惯了命令行操作，你就会发现它的效率其实比可视化要大得多。接口，尤其是批处理。

从GUI到CLI的转变就像在黑暗中关灯一样。一开始，灯光明亮，一切都看得见，周围的环境直观地印在脑海中。突然，灯灭了，一切都陷入黑暗，视线消失在脑海中。似曾相识的感觉让我一时间有些不知所措。一旦这个转变完成，你会发现实际上什么都没有改变，你将能够体验到在黑暗中快速控制一切的快感。这里还要补充的一件事是bash 有命令补全功能。使用过程中，无论是命令还是文件名，只需输入前几个字符，然后按tab键即可自动补全，可以大大提高工作效率。

在这个过程中，需要从命令用法、文件路径等最基本的东西开始，慢慢适应实践。然后，编写简单的脚本来实现简单的任务处理。然后，学习变量、分支判断、循环等简单的过程控制语法来完成复杂的批处理任务。很可能不需要复杂的编程，组学数据分析中的shell 脚本通常很简单。

在分析组学数据时，服务器不仅仅用于初步的数据处理。只要熟悉了，后期数据处理也可以轻松完成。例如，RNA-seq的预处理完成定量后，你可以选择将表达谱复制到自己的电脑上，用于后续的差异分析、富集等。但是，如果使用服务器来处理，你可以仍然欣赏文件共享的便利。有两个方面。首先，服务器是一个多用户系统。同一组中的用户可以共享文件并访问它们，而无需复制路径。其次，您仍然可以在另一台计算机上执行操作。只要有网络，可以登录服务器，就可以处理数据。复制数据并安装软件。

服务器确实很容易使用。使用与否取决于个人喜好。虽然这里的内容很基础，但是仍然可以给想要学习使用Linux服务器的初学者一些提示。时间长了，世界上的一切都会变得容易。每天都有废话，尤其是今天。废话不多说，来吧，让我们从开始到放弃。

关于Linux系统基础教程：新手入门必看指南和的介绍到此就结束了，不知道你从中找到你需要的信息了吗？如果你还想了解更多这方面的信息，记得收藏关注本站。