高效基因数据库Ensembl ID格式化指南

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大家好,今天小编来为大家解答以下的问题,关于高效基因数据库Ensembl ID格式化指南,这个很多人还不知道,现在让我们一起来看看吧!

#!/usr/bin/perl -w

使用严格;

打开IN,$ARGV[0] ||死$!

尽管(){

咀嚼;

我的$out=$_;

if (/gene_id "(S+)"; 基因版本"(d+)";/) {

我的$id=$1.".".$2;

$out=~ s/gene_id "(S+)";基因版本"(d+)";/基因ID "$id";/g;

}

if(/transcript_id "(S+)";transcript_version "(d+)";/){

我的$id=$1.".".$2;

$out=~ s/transcript_id "(S+)"; script_version "(d+)";/transcript_id "$id";/g;

}

if (/Protein_id "(S+)"; Protein_version "(d+)";/){

我的$id=$1.".".$2;

$out=~ s/Protein_id "(S+)"; Protein_version "(d+)";/Protein_id "$id";/g;

}

打印"$outn";

}

用户评论

墨城烟柳

学到新东西了!ensembl ID 到底是什么?

    有11位网友表示赞同!

沐晴つ

FORMAT是格式化吗?那这个ID要怎么理解啊?

    有14位网友表示赞同!

我家的爱豆是怪比i

听起来好专业的样子,不过我感觉自己不太懂...

    有18位网友表示赞同!

墨城烟柳

基因组数据果然很复杂...这FORMAT能让我更方便查询吗?

    有13位网友表示赞同!

伱德柔情是我的痛。

想学习一下ensembl ID ,有什么好的资源推荐吗?

    有8位网友表示赞同!

棃海

这个格式化能提高效率吗?感觉还挺有用的!

    有12位网友表示赞同!

人心叵测i

对于生物信息技术比较感兴趣的人来说,这个ID应该很有帮助吧?

    有16位网友表示赞同!

有恃无恐

我听说ensembl是一个很流行的数据库,看来它确实用到了这种ID格式!

    有14位网友表示赞同!

昂贵的背影

以前没想过基因组数据会有这么专门的ID...

    有13位网友表示赞同!

采姑娘的小蘑菇

这篇文章好像讲解得很透彻,让我对ensembl ID 有了一个更清晰的认识!

    有11位网友表示赞同!

长裙绿衣

感觉 FORMAT这个词挺有趣的,好像把数据编排得井然有序!

    有8位网友表示赞同!

话少情在

现在生物信息技术发展真是越来越快!这种ID格式化确实很有必要啊。

    有16位网友表示赞同!

红尘滚滚

我要去查阅一下ensembl的文档了,希望能了解更多关于ID的知识!

    有12位网友表示赞同!

妄灸

学习这些理论知识有时候也挺有趣儿的!

    有18位网友表示赞同!

灵魂摆渡人

这个FORMAT会不会像IP地址一样,不同基因有不同的识别码?

    有13位网友表示赞同!

轨迹!

应该有很多研究人员利用ensembl ID 来进行分析吧?

    有20位网友表示赞同!

命该如此

如果能学会使用ensembl ID,那我的生物信息方面的能力就更强大了!

    有13位网友表示赞同!

终究会走-

看来我想要学习生物信息技术还需要努力啊!

    有5位网友表示赞同!

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